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Software de Microbiología

2011/7/6
Además de los microscopios y los platos de Petri , las computadoras son una herramienta importante para los microbiólogos . Software para la investigación de la microbiología incluye herramientas utilizadas por otras disciplinas científicas y de ingeniería , así como aplicaciones especializadas para el estudio de las bacterias y otros microorganismos. Muchas de las aplicaciones desarrolladas por los organismos gubernamentales , las fundaciones sin fines de lucro o investigadores académicos están disponibles como software libre para descargar y utilizar como su experimento o laboratorio requiere . Herramientas de visualización

Una imagen mental o física de los datos en bruto que recogen pueden ayudarle a comprender mejor su calidad, relevancia e implicaciones. El código abierto y el software de visualización de datos comercial es ampliamente disponible para la investigación de la microbiología. Crear tablas y gráficos de sus datos mediante LibreOffice Calc , Excel de Microsoft o el sistema de visualización de datos Mondrian. Aplicaciones de la célula- O y RasMol ayudan a crear modelos en 2D y 3D de animación de moléculas biológicamente importantes , como las proteínas y los aminoácidos.
Modelos matemáticos

grandes colecciones de la microbiología datos a menudo dan información más significativa una vez que han sido analizados numéricamente. MATLAB , los paquetes de software de octava y SciPy que realizan refinamiento matemático , el análisis y la modelización de los datos científicos. Utilice estos paquetes de hacerlo a través de la estimación de parámetros de ajuste de curvas , las predicciones epidemiológicas , las simulaciones de crecimiento bacteriano y el ruido de los datos o la eliminación efecto estocástico. Estas aplicaciones también realizar cálculos estadísticos , como análisis de varianza y pruebas de Chi -cuadrado.

Genoma Bioinformática

aplicaciones de software de Microbiología también ayudan a visualizar y el mío información a partir de la secuencia de ácidos nucleicos que componen el ADN de un microorganismo . La Fundación Bioinformática Abierta ofrece secuenciación gratuito, de código abierto y aplicaciones de análisis de ADN como BioJava y Biopython que extraen datos de los bancos de datos del genoma , analizan código de ADN de un organismo y lo comparan con otras muestras de ADN. Paquetes adicionales de análisis del genoma incluyen Relieve, HMMER , Clustal Omega, Filogenia Inferencia Package o PHYLIP , y la secuencia de manipulación suite o SMS.
Referencia Software

El rápido ritmo del descubrimiento científico en microbiología y el cambio de las regulaciones del gobierno hace que sea esencial que los microbiólogos tienen fácil acceso a la información que afecta a su trabajo. HUGO es un paquete de software comercial que ofrece microbiólogos con la información actual sobre las herramientas , productos químicos , equipos , medios de cultivo , los requisitos de seguridad , nuevos organismos , cambios taxonómicos y antibióticos. Además , los microbiólogos que trabajan en ciencias de la alimentación pueden utilizar la aplicación Web Browser ComBase para acceder a los datos microbiológicos relacionados con la alimentación proporcionada por las agencias del gobierno en el Reino Unido , Australia y Estados Unidos.

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