Más específicamente, el Protein Data Bank (PDB) es un depósito de estructuras de proteínas, ácidos nucleicos y otras macromoléculas biológicas determinadas experimentalmente. Los archivos PDB almacenan las coordenadas atómicas y otros datos relacionados de estas moléculas, lo que permite a los científicos visualizar y analizar sus estructuras y estudiar las interacciones entre diferentes moléculas. Los archivos PDB se utilizan ampliamente en biología estructural, diseño de fármacos y otras áreas de investigación.