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¿Para qué se usa el formato SDF?

2014/3/19
El SDF (formato de datos de estructura) se usa principalmente para representar las estructuras químicas de las moléculas . Es un formato de archivo ampliamente utilizado en química y química computacional. Un archivo SDF puede contener una o más moléculas, cada una con su información estructural asociada y posiblemente propiedades adicionales.

La información codificada en un archivo SDF puede incluir:

* Conectividad molecular: Los átomos y los enlaces que componen la molécula.

* tipos de átomos: El tipo de elemento de cada átomo (por ejemplo, C, H, O, N).

* coordenadas de átomo (3D): La ubicación espacial de cada átomo, lo que permite la visualización de la estructura 3D de la molécula.

* Propiedades moleculares: Varios datos asociados con la molécula, como peso molecular, logp (coeficiente de partición de octanol-agua), cadena de sonrisas, tecla Inchi, etc.

Los archivos SDF suelen estar basados ​​en texto y utilizar un formato específico con líneas que comienzan con `> ` para denotar propiedades y bloques de datos que contienen la información del átomo y el enlace. Su flexibilidad los hace adecuados para almacenar grandes colecciones de estructuras moleculares y sus datos asociados, lo que los convierte en una opción popular para bases de datos y aplicaciones de detección virtual.

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