El sistema de archivos que contiene la mayoría de los archivos del sistema operativo es típicamente el sistema de archivos raíz
(a menudo denotado como `/` en sistemas similares a Linux/Unix y `c:\` en Windows). Aquí es donde residen el núcleo central, las bibliotecas del sistema y los binarios del sistema esenciales. Si bien otros sistemas de archivos pueden almacenar * algunos * archivos relacionados con el sistema operativo (por ejemplo, particiones de intercambio), la gran mayoría se encuentran en el sistema de archivos raíz.