Un gran inconveniente del uso de FTP desde la línea de comandos es su
falta de seguridad . FTP transmite datos en texto plano, lo que significa nombres de usuario, contraseñas y los datos en sí son fácilmente interceptados por cualquier persona que monitoree el tráfico de red. Esto lo hace altamente vulnerable a los ataques de espía y de hombre en el medio. Si bien SFTP (Protocolo de transferencia de archivos SSH) ofrece una alternativa segura, es un protocolo completamente diferente, no una característica del FTP de línea de comandos estándar.