Si bien ambos contienen información sobre particiones (unidades lógicas), la forma en que lo hacen difiere significativamente. El MBR es un estándar más antiguo, limitado en el número y el tamaño de las particiones que puede administrar. GPT es el estándar más nuevo y frecuente, que ofrece una mayor flexibilidad. Ambos esencialmente actúan como un directorio a la ubicación de inicio de cada unidad lógica en el disco físico.