Las supercomputadoras se pueden configurar para el acceso a múltiples usuarios, pero no es inherente a su definición. Múltiples investigadores o equipos utilizan muchas supercomputadoras, a menudo a través de un sofisticado sistema de programación de empleo que permite a muchos usuarios enviar tareas que luego se ejecutan en paralelo. Sin embargo, el sistema en sí mismo podría no ser directamente interactivo como un servidor típico de múltiples usuarios en el que iniciaría sesión con un entorno de escritorio. En cambio, los usuarios generalmente interactúan indirectamente mediante el envío de trabajos y luego verificando los resultados.